Lãnh đạo Trung tâm gồm Giám đốc và không quá 02 Phó Giám đốc:

Giám đốc là người đứng đầu Trung tâm, chịu trách nhiệm trước Giám đốc Sở Tài nguyên và Môi trường và trước pháp luật về toàn bộ hoạt động của Trung tâm.

Phó Giám đốc là người được Giám đốc phân công phụ trách một số lĩnh vực công tác; chịu trách nhiệm trước Giám đốc về lĩnh vực công tác được phân công.

Việc bổ nhiệm, miễn nhiệm, điều động, luân chuyển, khen thưởng, kỷ luật, từ chức, nghỉ hưu và thực hiện các chế độ chính sách đối với Giám đốc, Phó Giám đốc Trung tâm thực hiện theo quy định của pháp luật và theo phân cấp của Ủy ban nhân dân tỉnh.

Các phòng chuyên môn:

Phòng Hành chính - Tổng hợp;

Phòng Công nghệ thông tin - Lưu trữ;

Phòng Dịch vụ Tài nguyên và môi trường;

Phòng Kỹ thuật Đo đạc - Bản đồ.

Việc thành lập, bổ nhiệm nhân sự các phòng chuyên môn của Trung tâm thực hiện theo phân cấp và quy định pháp luật.